POS0742 SCREENING AND BIOINFORMATICS ANALYSIS OF HUB GENES AND PATHWAYS FOR PRIMARY SJÖGREN’S SYNDROME BASED ON GEO DATABASE

نویسندگان

چکیده

Background: Primary Sjögren’s syndrome (pSS) is an autoimmune disease that featured as lymphoplasmacytic infiltration of the exocrine glands leading to sicca symptoms 1 . However, its underlying molecular mechanisms remain elusive. Objectives: This study aims identify differentially expressed genes (DEGs) and pathways associated with progression pSS using bioinformatics analysis explore pathogenesis. Methods: The pSS-associated gene chip data set GSE66795 was obtained from Gene Expression Omnibus (GEO) database, which included 131 cases fully-phenotyped patients’ whole blood samples 29 control samples. DEGs were screened Using R software. Online tool Metascape 2 used make Ontology (GO) KEGG pathway enrichment. PPI network performed String database. Hub identified by Cytoscape. Results: A total 108 captured, including 101 up-regulated 7 down-regulated genes. GO enrichment showed these primarily enriched in defense response virus, interferon-gamma, regulation innate immune response, interferon-beta, double-stranded RNA binding, interferon-alpha. principally Influenza A, RIG-I-like receptor signaling pathway, necroptosis, Staphylococcus aureus infection. Finally, 9 hub (STAT1, IRF7, OAS2, GBP1, OAS1, IFIT3, IFIH1, OAS3, DDX60) had highest degree value. Conclusion: findings key may involve occurrence development pSS. References: [1]Francois H, Mariette X. Renal involvement primary Sjogren syndrome. Nat Rev Nephrol 2016;12(2):82-93. doi: 10.1038/nrneph.2015.174 [published First: 2015/11/17]. [2]Zhou Y, Zhou B, Pache L, et al. provides a biologist-oriented resource for systems-level datasets. Commun 2019;10(1):1523. 10.1038/s41467-019-09234-6 2019/04/05]. Acknowledgements: project supported National Science Foundation China (82001740), Open Fund Key Laboratory Cellular Physiology (Shanxi Medical University) (KLCP2019) Innovation Plan Postgraduate Education Shanxi Province (2020BY078). Disclosure Interests: None declared

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

fabrication of new ion sensitive field effect transistors (isfet) based on modification of junction-fet for analysis of hydronium, potassium and hydrazinium ions

a novel and ultra low cost isfet electrode and measurement system was designed for isfet application and detection of hydronium, hydrazinium and potassium ions. also, a measuring setup containing appropriate circuits, suitable analyzer (advantech board), de noise reduction elements, cooling system and pc was used for controlling the isfet electrode and various characteristic measurements. the t...

developing a pattern based on speech acts and language functions for developing materials for the course “ the study of islamic texts translation”

هدف پژوهش حاضر ارائه ی الگویی بر اساس کنش گفتار و کارکرد زبان برای تدوین مطالب درس "بررسی آثار ترجمه شده ی اسلامی" می باشد. در الگوی جدید، جهت تدوین مطالب بهتر و جذاب تر، بر خلاف کتاب-های موجود، از مدل های سطوح گفتارِ آستین (1962)، گروه بندی عملکردهای گفتارِ سرل (1976) و کارکرد زبانیِ هالیدی (1978) بهره جسته شده است. برای این منظور، 57 آیه ی شریفه، به صورت تصادفی از بخش-های مختلف قرآن انتخاب گردید...

15 صفحه اول

application of upfc based on svpwm for power quality improvement

در سالهای اخیر،اختلالات کیفیت توان مهمترین موضوع می باشد که محققان زیادی را برای پیدا کردن راه حلی برای حل آن علاقه مند ساخته است.امروزه کیفیت توان در سیستم قدرت برای مراکز صنعتی،تجاری وکاربردهای بیمارستانی مسئله مهمی می باشد.مشکل ولتاژمثل شرایط افت ولتاژواضافه جریان ناشی از اتصال کوتاه مدار یا وقوع خطا در سیستم بیشتر مورد توجه می باشد. برای مطالعه افت ولتاژ واضافه جریان،محققان زیادی کار کرده ...

15 صفحه اول

Identification of hub genes and pathways associated with retinoblastoma based on co-expression network analysis.

The objective of this paper was to identify hub genes and pathways associated with retinoblastoma using centrality analysis of the co-expression network and pathway-enrichment analysis. The co-expression network of retinoblastoma was constructed by weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) based on differentially expressed (DE) genes, and clusters were obtained through the molecular ...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Annals of the Rheumatic Diseases

سال: 2021

ISSN: ['1468-2060', '0003-4967']

DOI: https://doi.org/10.1136/annrheumdis-2021-eular.2021